Entre los programas que lleva adelante la reserva, se contemplan los proyectos de investigación, con el apoyo a las y los investigadores para que puedan desarrollarlos.
Esos son los casos de la bióloga Paula Vaschalde y el veterinario Johann Barolon, quienes están realizando su doctorado en el Laboratorio de Ecología de Enfermedades - ICIVET (CONICET - UNL), investigando bacterias del género Ehrlichia y sus asociaciones con diferentes tipos de garrapatas.
Uno de los lugares de muestreo elegido fue la Reserva Los Manantiales , sitio en el que trabajaron junto a otros becarios y uno de sus directores, el Dr. Sebastián Flores, quien trabaja en Ecología de enfermedades infecciosas transmitidas por garrapatas en el Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas (Conicet-UNC).
Su trabajo consiste en buscar garrapatas en distintos hospedadores silvestres, cómo las aves y los roedores , para luego llevarlas al laboratorio para determinar la presencia de la bacteria, que es de importancia sanitaria en Argentina.
